哈密瓜发苦的原因有两种，一是瓜蒂发苦，瓜类水果的瓜蒂部分有一些苦味素，这些苦味素是为了防止害虫的侵袭，保护哈密瓜不受到害虫的伤害，这种哈密瓜发苦是正常的，不吃瓜蒂部分即可。二是催熟致苦，催熟的哈密瓜果肉中的糖度不够，而且这种催熟的哈密瓜并不是真的成熟，因此吃起来都会带有一些苦味。
哈密瓜，新疆维吾尔自治区哈密地区特产，中国国家地理标志产品。哈密瓜主产于吐哈盆地（即吐鲁番盆地和哈密盆地的统称），它形态各异，风味独特，瓜肉肥厚，清脆爽口。哈密瓜营养丰富，含糖量最高达21%。哈密的甜瓜在东汉永平年间就成为进贡的异瓜种了。至清代，被哈密王作为贡品，受康熙赏赐而得名哈密瓜。时哈密瓜“往年进贡”、“瓜莫盛于哈密”、“瓜则充贡品者真出哈密”。追根溯源，哈密瓜却源于吐鲁番鄯善县一带。