食品级的益生菌有酪酸梭菌、乳酸菌、双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、酵母菌等。
1. 酪酸梭菌：酪酸梭菌又称酪酸梭状芽孢杆菌、酪酸杆菌、酪酸菌、丁酸梭状芽孢杆菌、丁酸梭菌、丁酸杆菌。丁酸菌是人的正常肠道菌之一，严格厌氧，为革兰阳性菌。
2. 乳酸菌：乳酸菌是一类能利用可发酵碳水化合物产生大量乳酸的细菌的统称。这类细菌在自然界分布极为广泛，具有丰富的物种多样性，至少包含18个属，共200多种。
3. 双歧杆菌：双歧杆菌是一个细菌属名。双歧杆菌属是一种革兰氏阳性、不运动、细胞呈杆状、一端有时呈分叉状、严格厌氧的细菌属，广泛存在于人和动物的消化道、阴道和口腔等生境中。
4. 嗜酸乳杆菌：嗜酸乳杆菌不仅在胃中，它还是人体小肠内的主要益生菌。
5. 酵母菌：酵母菌一般指酵母。酵母是基因克隆实验中常用的真核生物受体细胞，培养酵母菌和培养大肠杆菌一样方便。