酸奶不宜空腹饮用。人在空腹时，胃液中的pH值小于2，而酸奶中的乳酸菌要在pH值5或4以下的微酸环境中才能生长、繁殖，发生效应。
酸奶禁忌加热，温度越高，营养、乳酸菌损失越大。对于胃酸过多者，应与其他食物一同配合食用酸奶。
吃酸奶绝对不可搭配香肠腊肉等高油脂和加工肉品。因为加工肉品内添加了硝，也就是亚硝酸，会和酸奶的胺形成亚硝胺，是致癌物，所以尽量不要把酸奶和烧腊一起吃。
并非量越大越好。许多人喜欢喝酸奶，甚至把它当成了饮料，每天好几瓶。专家指出，喝酸奶并非越多越好，尤其是保健食品身份的酸奶，更要控制量。用量在一天两次为最佳。