口服精油一直是非常有争议的精油使用方式。在芳疗临床应用中经常被使用到，但其用量、用法都非常严谨甚至苛刻。并且有明确的规定，用于治疗性质的口服精油，需要有专业医师资格芳疗师的处方才可以。一般在处理人体消化系统、循环系统问题时会使用到。当然，也不是任何精油、任何病症都可以口服。
而且大家都知道精油不溶于水，所以更不能直接滴入水中或者直接滴入口腔来服用。如果真的需要口服精油，也会需要专业的胶囊或者助溶剂来进行稀释处理。
口服精油时，肝脏与消化道所分泌的酵素会与不同芳香分子结合，容易引起生化反应，减弱原本可能达到的效果，所以口服效果不一定最好，例如涂抹或吸闻真实薰衣草具安抚、镇定神经系统、促进皮肤再生的作用，但口服方式反而效果不佳。针对神经、呼吸系统，涂抹或吸闻的效果优于口服。